根據物流相關活動和資源的整合緊密程度，物流組織機構主要有以下5種模式。

1非整合的物流組織模式

非整合的物流組織模式，與傳統的組織模式相似，沒有專門的物流部門負責管理整個企業的物流活動，物流相關職能部門分散在其它職能部門內，而且同一物流職能也可能存在于多個部門中。

2職能整合組織模式

隨著市場變化的加劇，非整合的物流組織模式的弊端開始顯現出來，尤其是其協調同步性差的弊端嚴重降低了企業有效、快速地應對市場要求的能力。于是企業根據物流業務的需要，將物流相關功能進行組合和整合，成為一個統一的功能模塊為相應的物流業務服務。

3物流部門整合的組織模式

過去，企業主要是通過降低生產成本和管理成本來降低產品成本，提高競爭力。但是，隨著生產成本和管理成本降低空間越來越小以及原材料成本和人力資源成本的上升，企業為了在日趨激烈的競爭中生存和發展，將目光轉向了被譽為“第三利潤源”的物流領域。企業將物流提升到戰略高度，整合和優化物流資源，成立獨立的物流部門，統一管理和配置物流資源和物流活動。

4大物流組織模式

隨著消費者需求的多樣化、產品生命周期的縮短、市場競爭加劇等，都對物流運作提出了更高要求。這就要求物流與其它企業功能領域相結合，尤其是物流活動與采購、生產和銷售的協調配合，將采購、生產和銷售與物流進行整合，組建大物流部，統一管理物流業務、采購業務、生產業務和銷售業務。

5供應鏈一體化物流組織模式

隨著企業物流一體化的深入發展，物流的范圍不斷擴大，逐步延伸到企業上游供應商和下游各級經銷商、零售商及最終客戶，要求企業具備一條功能強大的供應鏈，對市場需求做出快速響應。供應鏈內的企業只有相互協調配合，才能發揮出供應鏈的整體競爭優勢。供應鏈一體化物流組織模式正是基于這種背景而產生的，它能夠站在一個更高的角度來統籌供應鏈內的相關物流活動，降低物流成本、提高物流效率，從而實現供應鏈整體利益和供應鏈內企業利益的最大化。